儿童晕厥多为自主神经介导性晕厥，其发病机制与自主神经功能紊乱有关。晕厥发作时大部分存在触发因素，包括长久站立，特别是在闷热环境、密闭空间或拥挤人群中长久站立；惊恐或疼痛，如静脉穿刺、预防接种、看到血液；饥饿、疲劳、睡眠不足、月经期、发热性疾病期间；剧烈运动后；过度换气与极度紧张；过度伸展、咳嗽；蹲位后快速站立；排尿或排便；快速失重（如“潜水员晕厥”）；某些药物，如乙醇、毒品（但有别于中毒）等。

由于上述触发因素，诱发机体的Bezold-Jarisch反射引起交感神经活性下降，迷走神经活性增强，导致反射性心动过缓，血压下降，脑血流量降低，意识丧失，肌张力难以维持正常姿势而摔倒。

上述触发因素中，主要为持久站立、闷热环境与运动。由闷热环境诱发的晕厥女孩高于男孩，排尿诱发的晕厥则男孩高于女孩。